La calprotectina è una proteina presente in grande quantità nei globuli bianchi (soprattutto nei granulociti neutrofili). La concentrazione di calprotectina nelle feci presenta un aumento significativo negli individui con infiammazioni intestinali (IBD), mentre non presenta livelli significativi negli individui con patologie non organiche, spesso di tipo funzionale, come la sindrome da colon irritabile (IBS).
Delle malattie infiammatorie intestinali fanno parte il morbo di Crohn e la colite ulcerosa. Durante il processo infiammatorio i globuli bianchi (granulociti) del sangue migrano nel lume intestinale attraverso la mucosa, rilasciando la calprotectina che viene eliminata intatta tramite le feci. E’ pertanto un importante marcatore di infiammazione intestinale.